87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2317 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  67.47 
 
 		 557 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 549 aa  1104    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  73.91 
 
 		 548 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 549 aa  1104    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  73.45 
 
 		 548 aa  806    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 549 aa  1104    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  37.23 
 
 		 555 aa  310  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.6 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 606 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  27.94 
 
 		 606 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  29.06 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 600 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 592 aa  123  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 592 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 604 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 611 aa  97.1  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 618 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.35 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  39.37 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  25.1 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.37 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 614 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.58 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.42 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  20.06 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.58 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.36 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  21.68 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  20.9 
 
 		 537 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  22.26 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 622 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  19.44 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  32.98 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  21.15 
 
 		 533 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  19.8 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  19.03 
 
 		 541 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 		 551 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 		 551 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 569 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  20.05 
 
 		 510 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.87 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  22.32 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  21.48 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  19.75 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  24.7 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.34 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 542 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  21.44 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.32 
 
 		 622 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 608 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  43.64 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  21.13 
 
 		 541 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 554 aa  44.3  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 590 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  20.78 
 
 		 533 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 536 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  29 
 
 		 635 aa  43.5  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 		 512 aa  43.5  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 580 aa  43.5  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>