More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4315 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 603 aa  1171    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  36.06 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.28 
 
 		 622 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  30.88 
 
 		 635 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 608 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 		 614 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 622 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 570 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  28.19 
 
 		 568 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 567 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 563 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.56 
 
 		 567 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.71 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  25.84 
 
 		 591 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 554 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 550 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 604 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 555 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.33 
 
 		 579 aa  97.4  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 565 aa  94.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 569 aa  90.5  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 581 aa  90.1  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.61 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  38.89 
 
 		 597 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 		 590 aa  77  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.52 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  25.63 
 
 		 606 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.25 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.61 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 543 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.36 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.49 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.54 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.53 
 
 		 527 aa  63.9  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.86 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.4 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 559 aa  62  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 631 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  25.58 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  22.95 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.91 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  22.04 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  25.72 
 
 		 535 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 555 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 622 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.79 
 
 		 515 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>