More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4005 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  99.64 
 
 		 554 aa  1112    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  67.81 
 
 		 558 aa  784    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  72.08 
 
 		 591 aa  812    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1119    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1119    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  67.15 
 
 		 550 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  41.95 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  42.49 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.3 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  37.23 
 
 		 566 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  37.97 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  36.56 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  37.41 
 
 		 576 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.14 
 
 		 579 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 565 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  32.6 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 581 aa  210  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 580 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 590 aa  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 569 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.2 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 592 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 604 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  27.18 
 
 		 619 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.87 
 
 		 585 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  24.2 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.16 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 567 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.15 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 566 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.69 
 
 		 622 aa  97.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 575 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 544 aa  91.3  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 524 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 603 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.47 
 
 		 540 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 		 529 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.54 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 569 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.29 
 
 		 495 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 611 aa  87  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.65 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  25.51 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 622 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 522 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 544 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.99 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 549 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.45 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.35 
 
 		 600 aa  81.3  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.16 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.16 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.3 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.24 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.16 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 619 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.7 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.9 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.25 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  29.24 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  21.67 
 
 		 588 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.01 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>