More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1116 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
581 aa  1195    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  49.82 
 
 
597 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
563 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  31.26 
 
 
585 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.52 
 
 
578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  33.08 
 
 
576 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
554 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 
566 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.31 
 
 
567 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 
567 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  30.37 
 
 
591 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
604 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
550 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  28.43 
 
 
568 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
592 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 
567 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 
606 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  27.01 
 
 
606 aa  170  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  27.66 
 
 
619 aa  167  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.46 
 
 
586 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
541 aa  161  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
600 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.34 
 
 
579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
592 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 
565 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
580 aa  143  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
611 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.55 
 
 
581 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 
635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
617 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
618 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.27 
 
 
622 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.2 
 
 
536 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.94 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.94 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.2 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
590 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.84 
 
 
536 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.02 
 
 
536 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.84 
 
 
536 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 
576 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
566 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
593 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
639 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
544 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 
587 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.96 
 
 
546 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
599 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
604 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
544 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
533 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 
538 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
548 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.67 
 
 
540 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 
629 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.91 
 
 
542 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
624 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
555 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.06 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
545 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 
539 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.51 
 
 
556 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
565 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 
544 aa  91.3  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
608 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  22.99 
 
 
544 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  33.7 
 
 
635 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 
603 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.07 
 
 
590 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.29 
 
 
534 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 
542 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.33 
 
 
560 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 
544 aa  88.6  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 
577 aa  88.6  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.53 
 
 
521 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.62 
 
 
535 aa  88.6  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.62 
 
 
535 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  28.62 
 
 
535 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
591 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
544 aa  88.6  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  21.67 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.53 
 
 
521 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.53 
 
 
521 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.53 
 
 
521 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
521 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
591 aa  87.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
578 aa  87  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>