More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1954 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 567 aa  1159    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  43.46 
 
 		 570 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  46.83 
 
 		 578 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  41.27 
 
 		 566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  38.92 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  41.05 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 554 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  39.89 
 
 		 576 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 550 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  36.85 
 
 		 591 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  31.41 
 
 		 565 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.03 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 580 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  32.9 
 
 		 551 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 581 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 592 aa  203  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 590 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 597 aa  180  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 569 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  27.41 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 586 aa  134  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.3 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 622 aa  124  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.19 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.78 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.74 
 
 		 622 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 624 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 624 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 624 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 566 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 617 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 606 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  28.94 
 
 		 635 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  23.48 
 
 		 619 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.43 
 
 		 532 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 559 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 593 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 522 aa  101  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 639 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 591 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 524 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.38 
 
 		 525 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  27.21 
 
 		 530 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  24.94 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.76 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 537 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.86 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 556 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 544 aa  94.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 544 aa  94  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 508 aa  94  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 615 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 622 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 534 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.5 
 
 		 575 aa  92  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.5 
 
 		 575 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 551 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  21.01 
 
 		 606 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 548 aa  91.3  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.49 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.77 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.72 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.95 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.04 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 595 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 581 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 575 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 627 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 561 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>