More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11306 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  72.08 
 
 		 555 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  72.08 
 
 		 555 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  64.53 
 
 		 550 aa  733    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  100 
 
 		 591 aa  1196    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  72.26 
 
 		 554 aa  810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  64.17 
 
 		 558 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  39.93 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.82 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  37.82 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  37.83 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  39.02 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  36.88 
 
 		 568 aa  320  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  36.35 
 
 		 576 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.31 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 580 aa  194  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 604 aa  127  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  26.47 
 
 		 619 aa  123  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.43 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.78 
 
 		 581 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  24.44 
 
 		 606 aa  107  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 		 592 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 575 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 		 611 aa  97.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 614 aa  97.4  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.77 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 622 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 503 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 551 aa  91.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 556 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 575 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 525 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  20.75 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.08 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.08 
 
 		 575 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.71 
 
 		 534 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 546 aa  87  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  20.28 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  24.56 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.28 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.36 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 604 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  19.51 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 627 aa  77  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 565 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.88 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 		 593 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  23.57 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>