More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1145 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 622 aa  1223    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  37.48 
 
 		 635 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 599 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 		 614 aa  359  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 		 608 aa  347  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.03 
 
 		 622 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  32.09 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  37.22 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  27.87 
 
 		 568 aa  124  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.4 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.77 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 567 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 576 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 597 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 581 aa  84  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  26.75 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  22.91 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  26.69 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.74 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  26.69 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.69 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 558 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 544 aa  63.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.47 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 543 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  27.56 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.76 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.4 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.49 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 522 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.84 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  24.86 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  27.23 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1343  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 510 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 534 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  21.2 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.19 
 
 		 527 aa  55.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.38 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 604 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 600 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 528 aa  55.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2310  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 603 aa  54.7  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 505 aa  54.3  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 532 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 631 aa  54.3  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 555 aa  54.3  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 556 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.51 
 
 		 505 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  20.67 
 
 		 554 aa  53.9  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>