173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2164 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  79.3 
 
 		 624 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  79.3 
 
 		 624 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  84.78 
 
 		 608 aa  953    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  79.3 
 
 		 624 aa  884    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 599 aa  1178    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  73.54 
 
 		 635 aa  827    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  42.01 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  38.23 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.52 
 
 		 622 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  37.39 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  34.48 
 
 		 603 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.78 
 
 		 567 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 567 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  24.18 
 
 		 568 aa  104  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  28.99 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 581 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.56 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 597 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 579 aa  90.5  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 551 aa  90.5  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 569 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  28.08 
 
 		 591 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 604 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.04 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.81 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.52 
 
 		 589 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 540 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.79 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  22.42 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.5 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.11 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 587 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 551 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  21.21 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.22 
 
 		 545 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  22.51 
 
 		 524 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 534 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 627 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.89 
 
 		 511 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 		 565 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 526 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 		 581 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 600 aa  54.7  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 548 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 629 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.62 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 526 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 548 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  35.85 
 
 		 619 aa  53.9  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 535 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.11 
 
 		 592 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 508 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 538 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.77 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 622 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  21.81 
 
 		 579 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.37 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 517 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2756  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 539 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 544 aa  51.2  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 520 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 511 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  22.77 
 
 		 538 aa  50.8  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.69 
 
 		 605 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 		 556 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  21.85 
 
 		 597 aa  50.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>