More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5593 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 567 aa  1147    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  40.78 
 
 		 570 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  42.78 
 
 		 578 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.11 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  39.04 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  39.62 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  37.83 
 
 		 591 aa  345  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 555 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 		 558 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 554 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  35.94 
 
 		 576 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 565 aa  293  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.19 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 		 551 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.56 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 592 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.64 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.6 
 
 		 622 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  27 
 
 		 585 aa  113  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 599 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.86 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 603 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.56 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 624 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 624 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 624 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 622 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 604 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 608 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  29.31 
 
 		 635 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 614 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 		 537 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 522 aa  93.6  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 611 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 526 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  21.15 
 
 		 606 aa  90.1  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 592 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  22.56 
 
 		 600 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  23.02 
 
 		 619 aa  88.2  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.96 
 
 		 524 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.88 
 
 		 556 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 575 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 506 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 605 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 587 aa  87  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  26.03 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 606 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.6 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.6 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.92 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  25.26 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.8 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.32 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.71 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.81 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.72 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 517 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.25 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.74 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.42 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  29.52 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.64 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>