More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4314 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 606 aa  1233    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  38.06 
 
 		 606 aa  415  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  39.53 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  34.74 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  38.09 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 592 aa  277  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  33.88 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  33.44 
 
 		 635 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.8 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 611 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 549 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 549 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 549 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 581 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  27.66 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 548 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 597 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 563 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 639 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.75 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 554 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.45 
 
 		 567 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 570 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 541 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.24 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.46 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  35.36 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.39 
 
 		 578 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  22.13 
 
 		 585 aa  94.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  21.97 
 
 		 568 aa  91.3  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 617 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  21.49 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 554 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.87 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  19.93 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  23.51 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.57 
 
 		 542 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 553 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.19 
 
 		 530 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.08 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.56 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.59 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  21.39 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  21.26 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.59 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5349  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  23.51 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.22 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  27.83 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  23.27 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  21.23 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.08 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.29 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  22.33 
 
 		 1437 aa  61.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  20.32 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.87 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3694  oligopeptide-binding protein OppA  21.2 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.308453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.25 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  19.52 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.2 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>