236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4114 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1227    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1227    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  78.78 
 
 		 608 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1227    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  78.97 
 
 		 599 aa  912    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  72.48 
 
 		 635 aa  865    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  41.25 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  38.23 
 
 		 622 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.31 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  37.69 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  33.45 
 
 		 570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.5 
 
 		 567 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  24.38 
 
 		 568 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 567 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.49 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.46 
 
 		 578 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 576 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 581 aa  93.2  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 551 aa  90.5  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 569 aa  89  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  28.03 
 
 		 591 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 597 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 590 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 604 aa  77  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.87 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 619 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.66 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.58 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.15 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 559 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  22.69 
 
 		 606 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 589 aa  60.1  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  21.62 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.65 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.4 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.79 
 
 		 545 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 557 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 494 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 559 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 645 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  23.08 
 
 		 495 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 566 aa  54.7  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 		 538 aa  54.3  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0148  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.46 
 
 		 551 aa  54.3  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000587403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 524 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 554 aa  54.3  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  20.99 
 
 		 574 aa  53.9  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 		 520 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.22 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  26.22 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 531 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27 
 
 		 518 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  21.9 
 
 		 561 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.34 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 536 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 622 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  24.25 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 544 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 546 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.11 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 524 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.49 
 
 		 511 aa  51.6  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  20.93 
 
 		 610 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 522 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 		 600 aa  51.2  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 514 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  22.37 
 
 		 538 aa  51.2  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 544 aa  51.2  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>