More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0818 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  100 
 
 
568 aa  1148    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  46.95 
 
 
578 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  45.54 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  42.78 
 
 
566 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  40.04 
 
 
567 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  39.82 
 
 
565 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  39.62 
 
 
567 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
550 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 
576 aa  332  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  36.88 
 
 
591 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
554 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.4 
 
 
579 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 
551 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
580 aa  169  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
569 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 
566 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
563 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
622 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.15 
 
 
622 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.12 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
603 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
624 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
624 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
624 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
604 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 
541 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  26.22 
 
 
635 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.17 
 
 
546 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 
562 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
599 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.48 
 
 
556 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.41 
 
 
585 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 
604 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
575 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.18 
 
 
589 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.5 
 
 
540 aa  94  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.37 
 
 
538 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.04 
 
 
526 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.04 
 
 
526 aa  93.2  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
538 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  23.96 
 
 
532 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.68 
 
 
575 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.47 
 
 
524 aa  91.3  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.97 
 
 
575 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
608 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
600 aa  90.5  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
551 aa  90.1  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 
514 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 
532 aa  90.1  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
539 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
575 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.94 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  22.98 
 
 
606 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 
533 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
534 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.02 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.2 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
557 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.86 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.47 
 
 
511 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
569 aa  84  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
567 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
629 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.81 
 
 
616 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.68 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.78 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.61 
 
 
580 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.61 
 
 
579 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
586 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.78 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  22.69 
 
 
619 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.69 
 
 
525 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
582 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  22 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.74 
 
 
550 aa  80.5  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  24.7 
 
 
524 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.69 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
531 aa  80.1  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.69 
 
 
492 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
532 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
595 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>