172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12605 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  67.86 
 
 		 549 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  67.86 
 
 		 549 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  65.11 
 
 		 548 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  67.86 
 
 		 549 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  66.42 
 
 		 548 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  100 
 
 		 557 aa  1113    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  38.31 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.82 
 
 		 581 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 606 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  28.03 
 
 		 619 aa  156  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  26.86 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 592 aa  120  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 592 aa  114  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 618 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 604 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 635 aa  97.4  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 611 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.07 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  37.3 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.41 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.41 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.49 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 550 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  20.64 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.19 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.4 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.62 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.4 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.4 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  21.49 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  20.21 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.48 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 		 557 aa  57  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.75 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  21.58 
 
 		 535 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  20 
 
 		 530 aa  56.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.16 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  20.7 
 
 		 533 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  20.93 
 
 		 538 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6175  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.17 
 
 		 543 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 537 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0148  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.41 
 
 		 551 aa  53.9  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000587403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 639 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  21.87 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 525 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.03 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  21.35 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 		 526 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3601  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  21.64 
 
 		 568 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.32 
 
 		 545 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  19.23 
 
 		 536 aa  51.2  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  19.06 
 
 		 541 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 555 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 555 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 		 533 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 		 522 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 550 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 		 576 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  23.02 
 
 		 536 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 550 aa  50.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.9 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  24.59 
 
 		 529 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 622 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3608  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.31 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  35.92 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  21.47 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.61 
 
 		 529 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 542 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>