More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0957 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 611 aa  1236    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  45.56 
 
 		 635 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  42.65 
 
 		 618 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 592 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 		 592 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  30.9 
 
 		 606 aa  263  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  30.73 
 
 		 600 aa  262  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  31.86 
 
 		 619 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 606 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29 
 
 		 581 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 586 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 597 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  28.53 
 
 		 591 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  32.31 
 
 		 683 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  25.16 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 567 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.75 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  24.93 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.59 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.8 
 
 		 507 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  34.13 
 
 		 505 aa  67  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.96 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.13 
 
 		 536 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.58 
 
 		 536 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  21.94 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.16 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.43 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.91 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.91 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  25.12 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.91 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  24.76 
 
 		 527 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  24.76 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  26.45 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.08 
 
 		 513 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 492 aa  55.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 532 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 521 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 525 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 522 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.64 
 
 		 540 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.73 
 
 		 529 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 492 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 524 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.49 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  21.61 
 
 		 593 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 		 535 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  21.17 
 
 		 600 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  20.24 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 549 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 517 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>