More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0952 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  100 
 
 
554 aa  1124    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  61.09 
 
 
552 aa  678    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 
543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  44.01 
 
 
534 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  45.93 
 
 
543 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  46.57 
 
 
543 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  46.86 
 
 
541 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 
543 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  43.73 
 
 
533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  39.93 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  43.46 
 
 
586 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  39.65 
 
 
543 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  40.62 
 
 
541 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  41.88 
 
 
522 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  42.74 
 
 
536 aa  350  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  37.75 
 
 
560 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  40.55 
 
 
585 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  38.29 
 
 
561 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  36.53 
 
 
527 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
547 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  40.21 
 
 
552 aa  320  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  36.19 
 
 
546 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  36.76 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
542 aa  300  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  34.42 
 
 
528 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  36 
 
 
541 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  34.54 
 
 
543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.31 
 
 
537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 
544 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
544 aa  183  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  29.29 
 
 
530 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  29.96 
 
 
530 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
535 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  28.68 
 
 
537 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  28.86 
 
 
537 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  28.86 
 
 
537 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
541 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  27.93 
 
 
537 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  28.68 
 
 
537 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.88 
 
 
520 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
594 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 
526 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
541 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
533 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
561 aa  148  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.1 
 
 
545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 
552 aa  147  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
545 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
533 aa  143  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
533 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
538 aa  143  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
556 aa  143  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
549 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 
532 aa  141  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
501 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
540 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
530 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
539 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.25 
 
 
540 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.09 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2242  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1815  extracellular solute-binding protein family 5  24.39 
 
 
535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.847688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
622 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.43 
 
 
558 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 
545 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
545 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.49 
 
 
536 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.86 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.84 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.68 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
532 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.09 
 
 
586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.17 
 
 
593 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.17 
 
 
593 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>