More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0252 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
546 aa  1113    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  67.58 
 
 
542 aa  748    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  52.76 
 
 
546 aa  571  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  47.19 
 
 
547 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  47.56 
 
 
585 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  45.67 
 
 
552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  44.49 
 
 
586 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  43.11 
 
 
543 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  41.15 
 
 
541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  44.66 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  40.84 
 
 
541 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  39.7 
 
 
560 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  49.56 
 
 
537 aa  333  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  36.76 
 
 
554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  37.06 
 
 
552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  36.29 
 
 
534 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  38.03 
 
 
533 aa  306  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  36.43 
 
 
543 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  37.25 
 
 
541 aa  296  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  36.61 
 
 
543 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
543 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  33.74 
 
 
522 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  35.33 
 
 
543 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.88 
 
 
537 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  35.88 
 
 
527 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  36.57 
 
 
536 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.13 
 
 
543 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 
528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
533 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 
544 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.83 
 
 
536 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.83 
 
 
536 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.83 
 
 
536 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
531 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 
536 aa  170  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.44 
 
 
536 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
544 aa  167  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  27.52 
 
 
530 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 
536 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
552 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.51 
 
 
536 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
532 aa  160  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 
594 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.39 
 
 
535 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  26.68 
 
 
530 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.29 
 
 
586 aa  156  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
534 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 
545 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 
530 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
541 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
530 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.92 
 
 
545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3602  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  27.44 
 
 
568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0236  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.55 
 
 
546 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1983  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.38 
 
 
542 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.776942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.88 
 
 
568 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0214  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.55 
 
 
546 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0195  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.55 
 
 
546 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0219  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.55 
 
 
546 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0194  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.55 
 
 
546 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5107  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.88 
 
 
546 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0182  solute-binding family 5 protein  28.55 
 
 
546 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 
622 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0185  solute-binding family 5 protein  28.36 
 
 
546 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1954  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 
542 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0666582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.16 
 
 
520 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
535 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  28.36 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0179  4-phytase  27.86 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  26.69 
 
 
571 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.18 
 
 
558 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
542 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
529 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.22 
 
 
537 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
538 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 
590 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 
549 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3378  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.65 
 
 
568 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1683  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, oppA-like  25.05 
 
 
542 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3644  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.65 
 
 
568 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.257621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3271  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
571 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1905  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
550 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
542 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
529 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1095  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
548 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1732  oligopeptide ABC transporter solute binding protein  24.91 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1709  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.18 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 
547 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.81 
 
 
520 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1240  oligopeptide-binding protein OppA  25 
 
 
548 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3475  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.73 
 
 
542 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4102  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
548 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3595  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.82 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000163174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1083  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
548 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>