More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4213 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 543 aa  1109    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  81.62 
 
 		 543 aa  923    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  78.49 
 
 		 543 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  80.33 
 
 		 543 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  81.43 
 
 		 541 aa  875    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  41.67 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  43.39 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  40.78 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  40.95 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  38.82 
 
 		 534 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  39.02 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  36.24 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  36.72 
 
 		 541 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.9 
 
 		 543 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  36.29 
 
 		 586 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  36.12 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  36.01 
 
 		 561 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  35.7 
 
 		 585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  35.33 
 
 		 546 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  32.87 
 
 		 536 aa  273  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.29 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  32.53 
 
 		 546 aa  257  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  31.94 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 543 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  36.47 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.47 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.47 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.84 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 533 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.28 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.1 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.1 
 
 		 536 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.91 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  28.55 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.21 
 
 		 541 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  27.37 
 
 		 544 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 622 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.22 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.77 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  27.12 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.5 
 
 		 558 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.68 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  25.48 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  25.68 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 538 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 541 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  27.08 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 538 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 533 aa  146  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.44 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 542 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  25.63 
 
 		 537 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  25.43 
 
 		 537 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  25.63 
 
 		 537 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  25.43 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 610 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.38 
 
 		 545 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  28.32 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  25.43 
 
 		 537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.69 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 544 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 560 aa  140  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 536 aa  140  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 556 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.21 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.93 
 
 		 545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 501 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 501 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 538 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 530 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 529 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>