More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3657 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  100 
 
 
536 aa  1087    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  42.62 
 
 
554 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  38.96 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  37.68 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 
543 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  35.46 
 
 
543 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  35.37 
 
 
541 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  35.37 
 
 
543 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  35.75 
 
 
534 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  33.39 
 
 
543 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  36.5 
 
 
533 aa  272  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  37.24 
 
 
522 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  35.8 
 
 
546 aa  257  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  36.4 
 
 
541 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.15 
 
 
586 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  32.59 
 
 
546 aa  243  6e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.64 
 
 
543 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  33.08 
 
 
560 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
542 aa  227  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  34.59 
 
 
541 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  31.53 
 
 
561 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  36.84 
 
 
552 aa  220  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
528 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
547 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  31.71 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 
527 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 
543 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  36.42 
 
 
537 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
594 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
533 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.58 
 
 
536 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.58 
 
 
536 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
536 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.58 
 
 
536 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
535 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
530 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.06 
 
 
536 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
501 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
536 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
542 aa  117  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  27.13 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.13 
 
 
530 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 
545 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1851  4-phytase  27.2 
 
 
546 aa  114  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00963288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2945  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
565 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472455  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
528 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 
494 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 
556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
541 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.95 
 
 
520 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 
554 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.89 
 
 
556 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.54 
 
 
529 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
533 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.83 
 
 
512 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.83 
 
 
512 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
544 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.48 
 
 
529 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.83 
 
 
512 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
519 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
505 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 
512 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.44 
 
 
512 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.83 
 
 
512 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.35 
 
 
551 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
561 aa  107  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.75 
 
 
493 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
528 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
535 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
492 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.83 
 
 
512 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0955  4-phytase  25.62 
 
 
534 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00228685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.77 
 
 
518 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.47 
 
 
510 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 
534 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.07 
 
 
517 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
517 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.56 
 
 
509 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
556 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
516 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
512 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
509 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 
622 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.65 
 
 
532 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  24.57 
 
 
537 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 
537 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
537 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  25.92 
 
 
537 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.54 
 
 
535 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>