More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  60.47 
 
 		 550 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18040  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 551 aa  1123    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153909  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  57.22 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  58.95 
 
 		 544 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  52.9 
 
 		 544 aa  545  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  45.94 
 
 		 551 aa  478  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 		 526 aa  256  7e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 499 aa  223  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 501 aa  201  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 551 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 539 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 541 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 543 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.13 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.1 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.57 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  25.29 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.76 
 
 		 517 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  22.77 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.33 
 
 		 545 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.1 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.59 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.59 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.29 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.59 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.73 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.59 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.73 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.55 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  23.55 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.55 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.94 
 
 		 505 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 505 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 489 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 527 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.37 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 516 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.07 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.74 
 
 		 532 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.44 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.44 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.44 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.71 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 560 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 		 544 aa  109  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  22.26 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  27.35 
 
 		 536 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 532 aa  108  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 552 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  24.06 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.39 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>