More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0573 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  100 
 
 		 530 aa  1082    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  86.23 
 
 		 530 aa  941    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  84.53 
 
 		 531 aa  945    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 		 590 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 594 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  32.77 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 541 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 		 544 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.97 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  31.19 
 
 		 558 aa  216  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 542 aa  216  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 550 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 544 aa  209  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 622 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 558 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 534 aa  206  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.8 
 
 		 540 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.02 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  31.74 
 
 		 540 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.34 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.47 
 
 		 520 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  30.44 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.41 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 547 aa  196  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 537 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  28.86 
 
 		 544 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 544 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 		 533 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  27.98 
 
 		 589 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.89 
 
 		 536 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  28.22 
 
 		 537 aa  193  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 535 aa  193  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 526 aa  193  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 537 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.89 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.22 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  28.22 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 543 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 525 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.92 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.1 
 
 		 536 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.92 
 
 		 525 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  28.04 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  27.95 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  27.77 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  27.95 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.37 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  27.77 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.43 
 
 		 526 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.43 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  28.99 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.92 
 
 		 536 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.92 
 
 		 536 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 544 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  27.58 
 
 		 537 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  27.71 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.55 
 
 		 536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 531 aa  183  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 545 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.61 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.42 
 
 		 558 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 536 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 552 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>