More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1116 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 635 aa  1279    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  49.53 
 
 		 618 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  45.56 
 
 		 611 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 		 592 aa  361  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  36.88 
 
 		 619 aa  330  5.0000000000000004e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  34.08 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  33.8 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  32.92 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  33.28 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  32.49 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 581 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.89 
 
 		 586 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 597 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  41.52 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 563 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 548 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 549 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 549 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 549 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 548 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.65 
 
 		 585 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 567 aa  87.4  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  23.81 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  23.08 
 
 		 495 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  25.86 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 528 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  21.57 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  22.56 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  20.92 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  21.61 
 
 		 535 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.35 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  26.26 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  20.9 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  21.81 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.81 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  21.81 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  21.81 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  22.42 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  20.08 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  20.67 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  23.34 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 529 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 529 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.5 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  22.15 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  21.72 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.1 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.48 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.33 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  20.13 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  20.14 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  21.09 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.81 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.81 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  20.22 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.81 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.81 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>