More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2541 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
592 aa  1185    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  58.69 
 
 
592 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  34.99 
 
 
635 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 
611 aa  300  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  36.05 
 
 
618 aa  299  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  33.57 
 
 
606 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  33.51 
 
 
619 aa  266  7e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  31.14 
 
 
606 aa  257  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.22 
 
 
581 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 
600 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.55 
 
 
586 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
581 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
604 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
555 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
550 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  25.71 
 
 
557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.62 
 
 
591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
563 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
555 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
555 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
554 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
558 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
549 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
549 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
549 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
548 aa  100  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  34.76 
 
 
683 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
535 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.87 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  21.61 
 
 
585 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
639 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 
522 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.39 
 
 
540 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
510 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
549 aa  80.5  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
536 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.33 
 
 
567 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.41 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
538 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  22.31 
 
 
546 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 
557 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.73 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
565 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
555 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.43 
 
 
578 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  21.49 
 
 
533 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 
565 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 
550 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
509 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 
576 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
610 aa  70.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  19.05 
 
 
536 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  23.84 
 
 
537 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.76 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
525 aa  68.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3694  oligopeptide-binding protein OppA  24.26 
 
 
564 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.308453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  25.44 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  25.15 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 
528 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  20.14 
 
 
532 aa  66.6  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  26.18 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.02 
 
 
528 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  21.81 
 
 
568 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.02 
 
 
528 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.13 
 
 
550 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.39 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 
567 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1624  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.18 
 
 
564 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00452052  normal  0.135982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.18 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
592 aa  66.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 
536 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.53 
 
 
528 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
516 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
551 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  22.26 
 
 
607 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
554 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.36 
 
 
579 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 
521 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  22.43 
 
 
537 aa  64.7  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
528 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 
587 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 
561 aa  64.7  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
528 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>