More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
601 aa  1232    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  38.34 
 
 
544 aa  336  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  34.66 
 
 
553 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.2 
 
 
550 aa  207  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 
551 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
546 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 
564 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  30.55 
 
 
560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  28.35 
 
 
560 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 
537 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.8 
 
 
535 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
534 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
511 aa  161  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 
542 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
554 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 
547 aa  157  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  30.07 
 
 
551 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 
541 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.8 
 
 
543 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 
547 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
541 aa  147  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 
545 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  29.05 
 
 
550 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  33.15 
 
 
537 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 
528 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 
554 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  30.61 
 
 
546 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
546 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
546 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  30.83 
 
 
538 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.89 
 
 
524 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.4 
 
 
524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.64 
 
 
524 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 
547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.4 
 
 
524 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  27.13 
 
 
554 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.4 
 
 
524 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
587 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.4 
 
 
524 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.75 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  28.16 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.65 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  28.16 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 
525 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  28.4 
 
 
524 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
595 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
512 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  31.3 
 
 
532 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.31 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
551 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
547 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  28.34 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.14 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.34 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 
506 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
509 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.1 
 
 
532 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.1 
 
 
532 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
492 aa  127  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.88 
 
 
544 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.51 
 
 
524 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.33 
 
 
526 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  26.8 
 
 
542 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.53 
 
 
521 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
543 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.85 
 
 
508 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
493 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
509 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.27 
 
 
521 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.27 
 
 
521 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 
520 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.27 
 
 
521 aa  123  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
521 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
519 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.41 
 
 
527 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.58 
 
 
526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  30.87 
 
 
532 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.77 
 
 
517 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.44 
 
 
566 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.31 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.81 
 
 
510 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 
503 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>