More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5507 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 582 aa  1194    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  37.79 
 
 		 586 aa  330  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.16 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.4 
 
 		 614 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 584 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 573 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 		 562 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  28.72 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.8 
 
 		 560 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 603 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 569 aa  213  7.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.74 
 
 		 593 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 599 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 584 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.34 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 587 aa  203  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  32.53 
 
 		 587 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.97 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 562 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 595 aa  154  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 610 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  24.14 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  24.91 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  24.61 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  21.92 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.31 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  25.5 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 600 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 543 aa  98.2  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 		 622 aa  97.8  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 588 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 545 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.33 
 
 		 566 aa  97.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  24.83 
 
 		 533 aa  97.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.22 
 
 		 567 aa  96.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  23.06 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 550 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  21.97 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 543 aa  94.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  25.09 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  22.76 
 
 		 540 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.05 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 515 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 544 aa  91.3  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 		 532 aa  90.5  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  24.95 
 
 		 559 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 528 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  24.45 
 
 		 543 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 515 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0148  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.45 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000587403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 552 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 539 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 		 565 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  23.41 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 528 aa  88.2  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.44 
 
 		 521 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 541 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 535 aa  88.2  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 590 aa  87.4  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  24.54 
 
 		 510 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.44 
 
 		 521 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.44 
 
 		 521 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.44 
 
 		 521 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 521 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 577 aa  87  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5706  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 552 aa  87  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.37 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.58 
 
 		 575 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  20.1 
 
 		 563 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  24.13 
 
 		 543 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.59 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.08 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.58 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  24.95 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>