More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 560 aa  1117    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  52.59 
 
 		 569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  56.55 
 
 		 573 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  52.68 
 
 		 562 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  37.88 
 
 		 564 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  34.57 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  35.12 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  33.1 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  34.54 
 
 		 584 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  33.9 
 
 		 587 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.02 
 
 		 593 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.89 
 
 		 562 aa  233  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.01 
 
 		 614 aa  229  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.51 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 584 aa  210  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 595 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 594 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 595 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 565 aa  150  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 561 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  25.23 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 510 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.21 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.81 
 
 		 542 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.17 
 
 		 540 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  23.21 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.14 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.09 
 
 		 521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 531 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  28.31 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 600 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.94 
 
 		 540 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 532 aa  128  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.56 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 513 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  26.32 
 
 		 523 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  26.98 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  27.57 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.95 
 
 		 567 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.82 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.77 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.46 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 515 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.66 
 
 		 505 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 543 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  25.35 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 		 504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.05 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  26.93 
 
 		 553 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.03 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.03 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 		 556 aa  114  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 516 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>