More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1553 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  56.87 
 
 		 587 aa  658    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  63.22 
 
 		 603 aa  722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 587 aa  1197    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  48.27 
 
 		 584 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  45.16 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  43.43 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  44.83 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  41.12 
 
 		 562 aa  399  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  35.27 
 
 		 610 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  34.52 
 
 		 594 aa  300  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  32.54 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  32.71 
 
 		 568 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 		 595 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 569 aa  243  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.27 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.74 
 
 		 573 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 570 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 562 aa  210  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.58 
 
 		 614 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 		 595 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 599 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  24.32 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 600 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 540 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  23.36 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 538 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 538 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 595 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 534 aa  100  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 522 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.02 
 
 		 565 aa  98.2  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 554 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 543 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.17 
 
 		 535 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 569 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.52 
 
 		 521 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.52 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.52 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.52 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 554 aa  93.6  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.8 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.9 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1851  4-phytase  26.25 
 
 		 546 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00963288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 566 aa  92  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 515 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.82 
 
 		 554 aa  91.3  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 512 aa  90.9  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.27 
 
 		 530 aa  90.5  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.61 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.61 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  22.61 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.61 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.61 
 
 		 493 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.58 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.74 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.87 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 528 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.44 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  27.12 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  25.73 
 
 		 541 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.67 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  24.35 
 
 		 533 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  22.67 
 
 		 516 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  24.31 
 
 		 554 aa  87.4  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 525 aa  87.4  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  23.28 
 
 		 533 aa  87  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 510 aa  87  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.35 
 
 		 524 aa  87  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  25.05 
 
 		 543 aa  87  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>