More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2296 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 584 aa  1192    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  53.92 
 
 		 587 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  52.72 
 
 		 603 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  51.55 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  48.81 
 
 		 587 aa  532  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  48.02 
 
 		 593 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  45.7 
 
 		 549 aa  465  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.14 
 
 		 562 aa  432  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  37.57 
 
 		 610 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  35.78 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 594 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  35.28 
 
 		 564 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  32.07 
 
 		 595 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 		 582 aa  233  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 569 aa  230  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.9 
 
 		 560 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.81 
 
 		 573 aa  203  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.54 
 
 		 614 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 595 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.68 
 
 		 535 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.65 
 
 		 540 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 539 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 540 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  25.23 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  25.64 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.26 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.29 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 533 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 552 aa  106  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.46 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.14 
 
 		 528 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.14 
 
 		 528 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.14 
 
 		 528 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.14 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 544 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 529 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 512 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 553 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 543 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 549 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 557 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.71 
 
 		 532 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.1 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 		 529 aa  94.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.05 
 
 		 515 aa  94  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.1 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.1 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.1 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 521 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 600 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 528 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 544 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  24.23 
 
 		 554 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.08 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 595 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 532 aa  90.5  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 543 aa  90.5  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  26.57 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.84 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.04 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.22 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.22 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  24.25 
 
 		 563 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.22 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 526 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 533 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.8 
 
 		 541 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.04 
 
 		 512 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.4 
 
 		 526 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 537 aa  87  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.39 
 
 		 493 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3349  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109598  normal  0.0359992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.64 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.04 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.42 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.29 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>