More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4716 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 533 aa  1087    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 528 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.47 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.91 
 
 		 508 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.91 
 
 		 520 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 510 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  25.7 
 
 		 523 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.82 
 
 		 541 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.25 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.25 
 
 		 492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.53 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.09 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.48 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 521 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.14 
 
 		 521 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 521 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 521 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.95 
 
 		 521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.61 
 
 		 504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.56 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  28.45 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 512 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 525 aa  127  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.37 
 
 		 524 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 493 aa  126  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.53 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 512 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 523 aa  123  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 515 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 562 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.48 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.42 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.19 
 
 		 537 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 495 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 538 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 528 aa  117  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.16 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.41 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.41 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  30.81 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  28.29 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 		 536 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 525 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 565 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 531 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27 
 
 		 524 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>