More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3398 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 528 aa  1077    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  58.63 
 
 		 521 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  57.87 
 
 		 522 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  58.82 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  53.61 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  55.22 
 
 		 522 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  54.46 
 
 		 519 aa  591  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  58.63 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7148  extracellular solute-binding protein  59.27 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0874465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  52.27 
 
 		 527 aa  588  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  55.03 
 
 		 523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  53.04 
 
 		 519 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  61.26 
 
 		 416 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3464  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  32.33 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7529  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33.42 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 495 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.71 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.04 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.81 
 
 		 520 aa  163  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.93 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.7 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 505 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  54.23 
 
 		 306 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 505 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 532 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.93 
 
 		 492 aa  151  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.93 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 544 aa  150  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 502 aa  150  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.98 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.67 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.53 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.21 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  26.71 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.54 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.54 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.54 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.54 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.35 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.35 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.35 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.25 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.25 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  32.25 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.11 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.71 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 540 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 504 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.98 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.98 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.98 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.98 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.76 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.88 
 
 		 550 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.05 
 
 		 546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 524 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 508 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.06 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.88 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>