More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4222 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7148  extracellular solute-binding protein  69.23 
 
 		 531 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0874465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  76.92 
 
 		 481 aa  771    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 521 aa  1052    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  62.86 
 
 		 525 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  64.62 
 
 		 519 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  63.39 
 
 		 520 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  63.98 
 
 		 522 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  71.15 
 
 		 519 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  61.8 
 
 		 522 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  58.44 
 
 		 528 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  64.64 
 
 		 527 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  64.05 
 
 		 523 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  63.2 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3464  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7529  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  35.57 
 
 		 541 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.11 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  57.45 
 
 		 306 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  27.66 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.08 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 502 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 551 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 517 aa  149  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.04 
 
 		 492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.04 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.92 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.95 
 
 		 513 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.61 
 
 		 524 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.92 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.92 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.92 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 521 aa  147  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.22 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.35 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 512 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.27 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.97 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.97 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.97 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 520 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 520 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.33 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.98 
 
 		 525 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.76 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.76 
 
 		 512 aa  136  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.95 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.76 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.47 
 
 		 550 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.88 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.62 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.88 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.07 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 501 aa  134  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 607 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 501 aa  133  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 518 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.41 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.24 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.74 
 
 		 526 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>