More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2171 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 580 aa  1161    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  39.82 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  38.09 
 
 		 557 aa  319  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 588 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2193  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0522887  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  27.48 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.19 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2908  extracellular solute-binding protein family 5  38.06 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.98 
 
 		 549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  25.14 
 
 		 587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.63 
 
 		 593 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  23.11 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 573 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.74 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.95 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.75 
 
 		 525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 561 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  23.56 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.43 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 544 aa  104  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 594 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 545 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 586 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  22.96 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 599 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  24.52 
 
 		 525 aa  97.1  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.79 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 545 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.52 
 
 		 545 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 545 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.44 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.72 
 
 		 565 aa  95.5  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 545 aa  94.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 610 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 568 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 529 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 		 547 aa  94.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  23.23 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  23.23 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 		 535 aa  93.6  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.79 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 538 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 		 543 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.56 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.56 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.56 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 549 aa  90.5  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.19 
 
 		 532 aa  90.5  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 544 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.37 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 		 594 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.46 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 529 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 538 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.01 
 
 		 531 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 538 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.31 
 
 		 558 aa  87.4  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  25.27 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  21.64 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.06 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>