55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2193 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2193  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 507 aa  979    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0522887  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 580 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  33.79 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 557 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2908  extracellular solute-binding protein family 5  37.84 
 
 		 501 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  24.4 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.83 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.23 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  24.75 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 562 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.93 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 544 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.33 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  21.93 
 
 		 610 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  23.88 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.89 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 570 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.42 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 564 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.53 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  23.1 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 542 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  22.34 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  35.06 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  21.02 
 
 		 543 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  20.22 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  34.38 
 
 		 551 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.99 
 
 		 526 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.99 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 		 558 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.99 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.99 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 508 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 560 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  22.99 
 
 		 526 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>