More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7148 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
586 aa  1198    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  42.89 
 
 
570 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 
582 aa  336  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  39.16 
 
 
568 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  36.22 
 
 
564 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 
573 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
569 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.06 
 
 
573 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.01 
 
 
560 aa  276  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.23 
 
 
614 aa  272  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  34.46 
 
 
562 aa  270  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 
584 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.94 
 
 
593 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.42 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  31.61 
 
 
587 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 
584 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.4 
 
 
549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 
603 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 
587 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 
595 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
594 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
610 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  26 
 
 
566 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  25.61 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
561 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
595 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 
539 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
549 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
580 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.43 
 
 
540 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
538 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
622 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
540 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  24.15 
 
 
540 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
600 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  21.24 
 
 
557 aa  93.6  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
557 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
533 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 
544 aa  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
516 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  21.04 
 
 
544 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  22.54 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.11 
 
 
566 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  25.62 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.85 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  23.45 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.31 
 
 
516 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.31 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  22.18 
 
 
544 aa  79.3  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
521 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.31 
 
 
516 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.31 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  21.97 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
547 aa  77  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 
550 aa  77  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  22.32 
 
 
535 aa  73.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
520 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.88 
 
 
516 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
520 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
544 aa  72.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.77 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  23.18 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.48 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
595 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.05 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.22 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
628 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.08 
 
 
625 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  22.24 
 
 
523 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  21.7 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  21.99 
 
 
559 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>