More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1850 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  60.38 
 
 		 593 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 584 aa  1190    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  50.68 
 
 		 584 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  49.45 
 
 		 549 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  46.07 
 
 		 603 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  45.07 
 
 		 587 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  45.99 
 
 		 587 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.78 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  36.93 
 
 		 610 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  36.97 
 
 		 564 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  37.79 
 
 		 595 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  35.74 
 
 		 568 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  33.7 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 		 570 aa  299  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  32.77 
 
 		 562 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.58 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.63 
 
 		 560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 586 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 569 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 573 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.35 
 
 		 614 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 599 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  27.7 
 
 		 566 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 580 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  25.42 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 540 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 540 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 538 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.7 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 535 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 600 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 526 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.97 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 528 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 561 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 588 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.12 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.12 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.12 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.12 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.23 
 
 		 520 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 		 565 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 545 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.33 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0866  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 535 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 524 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.58 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.74 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.74 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 594 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 516 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 493 aa  104  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.53 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 533 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.61 
 
 		 516 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 532 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.11 
 
 		 493 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.53 
 
 		 520 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.32 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.81 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.79 
 
 		 507 aa  101  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.86 
 
 		 516 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  22.5 
 
 		 563 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.71 
 
 		 524 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 506 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  23.03 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 516 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 532 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  24.18 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.07 
 
 		 502 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>