More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2038 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
557 aa  1097    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 
580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  34.44 
 
 
557 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2908  extracellular solute-binding protein family 5  39.14 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
600 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
588 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2193  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 
507 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0522887  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.66 
 
 
562 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  25.8 
 
 
564 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
595 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
570 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.23 
 
 
573 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  25.41 
 
 
587 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 
594 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
562 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 
560 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
584 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.14 
 
 
593 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.54 
 
 
614 aa  94.7  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 
569 aa  92.8  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
603 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 
586 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  20.89 
 
 
582 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 
556 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.22 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 
525 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.89 
 
 
543 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
587 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
556 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.12 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 
545 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
545 aa  81.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.69 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1285  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.73 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.96 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
540 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  24.78 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  25.6 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.84 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.73 
 
 
558 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.57 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  24.57 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.08 
 
 
543 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  24.57 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  24.57 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  22.51 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  22.51 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 
537 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.51 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
573 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.08 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.51 
 
 
543 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.51 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
526 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  22.08 
 
 
525 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.13 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.38 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
533 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.38 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.38 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.38 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.3 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.32 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
552 aa  72.8  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
547 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 
545 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  22.32 
 
 
536 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
528 aa  72  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.08 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  23.74 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  23.81 
 
 
558 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 
521 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  24.83 
 
 
539 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.34 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.23 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
544 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  22.91 
 
 
543 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.34 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>