More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 562 aa  1125    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  47.35 
 
 		 549 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  42.78 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  42.55 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  42.86 
 
 		 603 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  42.78 
 
 		 584 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  41.12 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  40.52 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  35.87 
 
 		 610 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  38.92 
 
 		 595 aa  333  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  34.36 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  34.12 
 
 		 570 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  33.4 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 594 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.58 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 569 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.7 
 
 		 560 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 562 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 		 586 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 		 582 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.55 
 
 		 614 aa  170  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 595 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.29 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.36 
 
 		 540 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  24.44 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 538 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 600 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 557 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  23.22 
 
 		 566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 588 aa  117  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 557 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.22 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 528 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  23.84 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  26.28 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.73 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.97 
 
 		 542 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  21.13 
 
 		 520 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 505 aa  97.4  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 523 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  22.7 
 
 		 543 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 563 aa  97.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  22.7 
 
 		 543 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 		 558 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 		 543 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 558 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 		 558 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 		 543 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.63 
 
 		 543 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.43 
 
 		 512 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 501 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 532 aa  96.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  23.2 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.02 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  23.44 
 
 		 543 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.2 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 532 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.01 
 
 		 493 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 		 512 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  22.01 
 
 		 512 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.01 
 
 		 512 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.85 
 
 		 543 aa  94.4  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 589 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 512 aa  94.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  25.29 
 
 		 516 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 534 aa  94.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 501 aa  94  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.22 
 
 		 512 aa  94  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 543 aa  94  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.01 
 
 		 512 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.01 
 
 		 512 aa  93.6  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 512 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  22.25 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.04 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  24.31 
 
 		 533 aa  92.8  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  24.23 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>