More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 573 aa  1155    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  53.77 
 
 		 562 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  56.7 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  51.74 
 
 		 569 aa  565  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  38.07 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  36.28 
 
 		 564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 		 570 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  36.06 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  34.93 
 
 		 573 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  34.45 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  32.33 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.58 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  34.58 
 
 		 584 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 603 aa  230  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.9 
 
 		 614 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.21 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 		 582 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 595 aa  213  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  31.8 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 594 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 561 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 549 aa  150  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 540 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 540 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  24.96 
 
 		 566 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.41 
 
 		 540 aa  138  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  28.1 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 595 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  25.3 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.91 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  25.83 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.09 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.09 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.09 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  25.7 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 580 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 538 aa  124  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 513 aa  123  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  27.08 
 
 		 541 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 505 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 588 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  25.66 
 
 		 552 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  25.66 
 
 		 552 aa  120  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.37 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 		 529 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 532 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  22.41 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.86 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.63 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.47 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  24.26 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 515 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.13 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.43 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0902  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000121973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.43 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.43 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.43 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.6 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0866  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 557 aa  107  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 569 aa  107  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 526 aa  107  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>