More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4557 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 570 aa  1153    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  39.34 
 
 		 568 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  41.05 
 
 		 564 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  42.89 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  37.32 
 
 		 562 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  36.3 
 
 		 593 aa  316  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.9 
 
 		 573 aa  316  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  36.28 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.12 
 
 		 562 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  38.1 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.26 
 
 		 549 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  33.28 
 
 		 584 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  36.25 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  32.1 
 
 		 603 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  35.07 
 
 		 587 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.44 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 582 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  32.47 
 
 		 610 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 599 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 594 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 595 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  27.46 
 
 		 566 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.13 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 540 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.96 
 
 		 540 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  26.97 
 
 		 568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 580 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 507 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 		 565 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 622 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 514 aa  113  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  25.91 
 
 		 563 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 544 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.59 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 509 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 600 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.2 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 544 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 512 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.76 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  23.87 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.41 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.99 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.19 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.19 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.19 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  27.45 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.41 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.99 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  24.38 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 523 aa  104  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 589 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 550 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  104  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 531 aa  104  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  29.37 
 
 		 531 aa  103  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.07 
 
 		 502 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.83 
 
 		 508 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.68 
 
 		 524 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.22 
 
 		 524 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 552 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.25 
 
 		 526 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.18 
 
 		 510 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.28 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 		 538 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>