More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2586 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  62.12 
 
 		 587 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  65.57 
 
 		 587 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 603 aa  1222    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  51.79 
 
 		 584 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  45.09 
 
 		 593 aa  505  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  46.07 
 
 		 584 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  46.35 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.86 
 
 		 562 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  37.21 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  35.53 
 
 		 564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  34.4 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  33.16 
 
 		 594 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  34.7 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  32.57 
 
 		 570 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 573 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.17 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 569 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.61 
 
 		 614 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 595 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 599 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 540 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.69 
 
 		 540 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 600 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 580 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 538 aa  124  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  23.6 
 
 		 568 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  23.42 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 528 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.06 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 554 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0142  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 551 aa  100  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.05 
 
 		 590 aa  98.2  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 557 aa  97.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 531 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4716  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 517 aa  94.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 550 aa  94.4  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.67 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  23.12 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  26.63 
 
 		 531 aa  92  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.12 
 
 		 493 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.58 
 
 		 565 aa  91.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 516 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  23.49 
 
 		 512 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 528 aa  90.9  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.94 
 
 		 512 aa  90.9  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.94 
 
 		 512 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  23.3 
 
 		 512 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  23.3 
 
 		 512 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  23.3 
 
 		 512 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2038  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 557 aa  90.9  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 522 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.94 
 
 		 512 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.51 
 
 		 544 aa  88.2  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 521 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 517 aa  87  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.21 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 610 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  23.84 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  24.58 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.18 
 
 		 520 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.58 
 
 		 554 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.65 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  24.35 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.64 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  22.6 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>