More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5889 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
595 aa  1200    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  29.98 
 
 
564 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  30.24 
 
 
587 aa  181  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.2 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 
603 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 
584 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.17 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.33 
 
 
560 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.84 
 
 
593 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 
587 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
562 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.6 
 
 
549 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
538 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  26.13 
 
 
566 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
538 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  31.95 
 
 
595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
584 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.72 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
539 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
540 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 
550 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.82 
 
 
540 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
610 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 
573 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
561 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
586 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
544 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  26.35 
 
 
563 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 
545 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
594 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.85 
 
 
614 aa  108  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
554 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 
582 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
535 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
543 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
544 aa  104  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  21.29 
 
 
568 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  25.98 
 
 
532 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
533 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  26.13 
 
 
532 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  22.34 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.8 
 
 
520 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
531 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  23.1 
 
 
530 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
510 aa  91.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 
549 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
622 aa  91.3  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 
557 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.49 
 
 
565 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
525 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
526 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
543 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 
563 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
600 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  23.09 
 
 
524 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
522 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 
538 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.84 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.84 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.84 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 
521 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 
505 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
554 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  23 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1641  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
588 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0558371  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  24.9 
 
 
533 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.66 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 
594 aa  84  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
599 aa  84  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.87 
 
 
525 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.36 
 
 
546 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.83 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  22.41 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.91 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  25.43 
 
 
535 aa  80.5  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.78 
 
 
525 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2854  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.14 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00038911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
526 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  23.52 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  23.52 
 
 
586 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.42 
 
 
513 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2896  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  19.97 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  22.43 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.11 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>