More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2848 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  100 
 
 		 563 aa  1150    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  50.47 
 
 		 561 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  46.31 
 
 		 568 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  47.45 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 563 aa  179  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  30.52 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.62 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.49 
 
 		 540 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 538 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.82 
 
 		 568 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  25.54 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 595 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  23.87 
 
 		 587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.28 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 562 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.26 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 584 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.33 
 
 		 549 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.51 
 
 		 531 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  25.47 
 
 		 533 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.74 
 
 		 560 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.88 
 
 		 573 aa  107  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  25.05 
 
 		 529 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  28.06 
 
 		 516 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  26.87 
 
 		 530 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 558 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  25.36 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.9 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.14 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.36 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  25.36 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.94 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 531 aa  101  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 533 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 590 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 538 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.93 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.7 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 537 aa  98.6  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  22.78 
 
 		 622 aa  97.8  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2236  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 547 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 502 aa  97.8  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4438  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 538 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.9 
 
 		 545 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 		 562 aa  97.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 538 aa  97.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 525 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 509 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.58 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 		 535 aa  94.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  23.52 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 550 aa  94  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 544 aa  94  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 525 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 573 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  23.95 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>