More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2400 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 599 aa  1224    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  32.29 
 
 		 586 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.85 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0438  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000302418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  31.03 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5507  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2982  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.270832  normal  0.0254721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12470  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.96 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185176  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.35 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  30.78 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.13 
 
 		 573 aa  186  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  32.58 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5913  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  30.25 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0808698  normal  0.0457082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2049  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  28.15 
 
 		 587 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 584 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 587 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 603 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.31 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 594 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 610 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 580 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 622 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 545 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 549 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  23.29 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  22.57 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  24.03 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.04 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  21.41 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4973  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.55 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  24.34 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  22.3 
 
 		 549 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2067  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 600 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.23 
 
 		 545 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.3 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.3 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  22.24 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  21.61 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  21.56 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  23.42 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  23.89 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0866  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  22.76 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  23.72 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  23.2 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.13 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.42 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  23.61 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.45 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  23.45 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  23.45 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  23.45 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  23.46 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.74 
 
 		 525 aa  72  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.47 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  23.23 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0979  ABC transporter, substrate-binding protein  24.8 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  24.95 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.99 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  23.16 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  21.95 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 		 536 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 545 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  21.86 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  20.7 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.27 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.51 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 601 aa  67.8  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>