More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2177 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2177  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
554 aa  1116    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3425  extracellular solute-binding protein family 5  39.85 
 
 
563 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0438  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 
549 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
561 aa  236  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  28.7 
 
 
568 aa  230  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2124  hypothetical protein  28.34 
 
 
566 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415891  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2848  4-phytase  30.65 
 
 
563 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540815  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
538 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  28.05 
 
 
587 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3512  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.97 
 
 
568 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321069  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
622 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.02 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.15 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4719  4-phytase  27.1 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0883166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33430  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.83 
 
 
562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33360  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.44 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.722475  normal  0.940695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5889  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 
595 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1850  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 
584 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
526 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
526 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 
539 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  26.85 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
529 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
545 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  26.29 
 
 
529 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2586  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653336  decreased coverage  0.00337365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.45 
 
 
541 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
533 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
532 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
522 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
543 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4557  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
570 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2171  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
580 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596914  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1553  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 
587 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.525667  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 
589 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 
532 aa  107  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
594 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
531 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.94 
 
 
545 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1289  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 
610 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172232  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
535 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.13 
 
 
532 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
526 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0833  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 
532 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 
535 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.21 
 
 
531 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 
535 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.57 
 
 
525 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 
535 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.65 
 
 
573 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0290  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
531 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.752502  normal  0.021899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
535 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
528 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1286  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
594 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
545 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 
533 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.75 
 
 
526 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.75 
 
 
526 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0226  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
533 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.75 
 
 
526 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.35 
 
 
525 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 
528 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2457  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
562 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
543 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
539 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
550 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 
526 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
516 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  23.86 
 
 
543 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 
532 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
538 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.98 
 
 
516 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.47 
 
 
516 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2296  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
584 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000797709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
532 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 
590 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 
516 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
525 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  25.26 
 
 
531 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0536  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.86 
 
 
549 aa  97.8  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
510 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  23.47 
 
 
516 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.27 
 
 
516 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  23.63 
 
 
509 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
532 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.47 
 
 
516 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 
534 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.35 
 
 
560 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
521 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>