More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1036 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  91.03 
 
 
524 aa  983    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
524 aa  1068    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
510 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.15 
 
 
504 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 
520 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.53 
 
 
520 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
521 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.28 
 
 
520 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  27.87 
 
 
517 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.75 
 
 
517 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29 
 
 
521 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
520 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
528 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 
515 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  25.62 
 
 
520 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.81 
 
 
520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
520 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
520 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
520 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
495 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
535 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.39 
 
 
530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  27.8 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
544 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
520 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.14 
 
 
512 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.14 
 
 
512 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.14 
 
 
512 aa  134  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.16 
 
 
521 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.16 
 
 
521 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.16 
 
 
521 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
521 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.14 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.95 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.95 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
518 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
505 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.16 
 
 
521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.72 
 
 
493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
517 aa  130  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  23.13 
 
 
509 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
532 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
595 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.53 
 
 
516 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
502 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 
516 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 
527 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
512 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
549 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
517 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.29 
 
 
518 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.78 
 
 
512 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.78 
 
 
512 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
521 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.78 
 
 
512 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.57 
 
 
512 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
512 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.57 
 
 
512 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.48 
 
 
542 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  25.71 
 
 
523 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
526 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
520 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 
533 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
527 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  30.15 
 
 
530 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 
514 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.89 
 
 
535 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 
514 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.73 
 
 
535 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.89 
 
 
535 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
631 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.08 
 
 
504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.15 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>