More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2269 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2269  homocitrate synthase  100 
 
 		 287 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.613685  normal  0.0966647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  49.3 
 
 		 382 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  48.75 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  46.85 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4041  trans-homoaconitate synthase  46.95 
 
 		 372 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.397636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  47.33 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  48.9 
 
 		 381 aa  262  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  47.62 
 
 		 389 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  46.32 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  46.95 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  45.88 
 
 		 383 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  46.83 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  48.16 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  46.26 
 
 		 385 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0254  homocitrate synthase  45.59 
 
 		 384 aa  255  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1366  homocitrate synthase  45.26 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0409  pyruvate carboxyltransferase  46.79 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000285195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  45.79 
 
 		 382 aa  251  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  47.43 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7741  homocitrate synthase  45.96 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  45.42 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  45.79 
 
 		 383 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0692  trans-homoaconitate synthase  46.52 
 
 		 383 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  46.52 
 
 		 390 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  45.88 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1438  putative homocitrate synthase  45.22 
 
 		 378 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435894  normal  0.0132652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3368  trans-homoaconitate synthase  45.05 
 
 		 383 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  44.49 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  44.49 
 
 		 377 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1372  homocitrate synthase  44.85 
 
 		 377 aa  242  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2310  homocitrate synthase  46.32 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  45.26 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2367  trans-homoaconitate synthase  42.7 
 
 		 377 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0424  trans-homoaconitate synthase  45.42 
 
 		 380 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  44.49 
 
 		 394 aa  232  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0150  homocitrate synthase  45.19 
 
 		 415 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5088  homocitrate synthase  44.44 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  42.49 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0485  homocitrate synthase  44.07 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  42.22 
 
 		 413 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  41.82 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2181  homocitrate synthase  45.59 
 
 		 391 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.703624  normal  0.187711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1059  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 		 377 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0529  homocitrate synthase  45.59 
 
 		 358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0982  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.952279  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4489  pyruvate carboxyltransferase  44.07 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  42.03 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  40.73 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  40.73 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1258  homocitrate synthase  45.59 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1086  Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase  44.44 
 
 		 394 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1557  homocitrate synthase  42.14 
 
 		 379 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5875  homocitrate synthase  43.72 
 
 		 379 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0690  homocitrate synthase  41.82 
 
 		 389 aa  205  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.784168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1919  homocitrate synthase  41.88 
 
 		 375 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00307593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3619  pyruvate carboxyltransferase  38.63 
 
 		 390 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4450  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1229  homocitrate synthase  40.44 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3580  homocitrate synthase  46.67 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483441  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0505  homocitrate synthase  41.18 
 
 		 381 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  39.34 
 
 		 514 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  40.44 
 
 		 492 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  39.35 
 
 		 492 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1624  pyruvate carboxyltransferase  39.56 
 
 		 390 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.273751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  39.86 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.93 
 
 		 500 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  40.07 
 
 		 492 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  38.85 
 
 		 505 aa  189  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  40.07 
 
 		 492 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1526  homocitrate synthase  38.18 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  37.41 
 
 		 504 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1747  pyruvate carboxyltransferase  38.1 
 
 		 383 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.73975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  36.63 
 
 		 514 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  38.32 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  37 
 
 		 514 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1918  homocitrate synthase  39.71 
 
 		 385 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  36.13 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  35.87 
 
 		 514 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  35.11 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  37.82 
 
 		 406 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  36.77 
 
 		 377 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  35.51 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  37.23 
 
 		 485 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.07 
 
 		 504 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  37.5 
 
 		 508 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  36.76 
 
 		 491 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  37.14 
 
 		 393 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  36.59 
 
 		 394 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  36.73 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  36.1 
 
 		 492 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  35.4 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  39.26 
 
 		 483 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  36.23 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  36.2 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  34.67 
 
 		 386 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  34.55 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  37.85 
 
 		 511 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  38.16 
 
 		 503 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>