93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  100 
 
 		 211 aa  397  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  40.71 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  40.44 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  39.13 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  38.3 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  39.26 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  41.53 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  42.34 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  37.32 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  36.84 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  39.1 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  30 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  33.09 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  37.69 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  42.06 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  31.88 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 326 aa  52  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  34.35 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  30 
 
 		 313 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 321 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 302 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  31.39 
 
 		 313 aa  48.9  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 302 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  32.33 
 
 		 295 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  30.47 
 
 		 320 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  28.06 
 
 		 306 aa  48.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  34.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  26.12 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  31.54 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  39.44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  34.15 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 311 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  32.31 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  22.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.09 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 295 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  30.46 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 304 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 321 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 325 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 287 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  22.31 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 324 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.08 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  25.52 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  32.09 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  26 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 328 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0539  type II secretion system protein  30 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 324 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 325 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  43.08 
 
 		 448 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 312 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 322 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 324 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.19 
 
 		 334 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 326 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  26.81 
 
 		 338 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 321 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  24.63 
 
 		 319 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  27.2 
 
 		 273 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>