46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 361 aa  665    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  35.59 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  39.73 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  42.27 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  41.13 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  43.24 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  33.45 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  36.67 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  45 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  37.32 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  33.77 
 
 		 200 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  34.97 
 
 		 200 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  39.01 
 
 		 183 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  35.21 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  35.21 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  34.27 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  34.75 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  42.59 
 
 		 263 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  33.85 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  37.89 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  33.65 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  37.5 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  33.33 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  33.1 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  38 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  37.3 
 
 		 253 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  37.78 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  38.79 
 
 		 141 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  42.72 
 
 		 211 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  40.43 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  39.06 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  36.7 
 
 		 234 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.69 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  33.98 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  34.93 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  26.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  38 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>