121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5868 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  43.5 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  48.44 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  36.31 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  40.54 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  38.46 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  28.38 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  34.78 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  31.63 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  34.51 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  30.49 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  31.85 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  38.1 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  37.34 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  29.3 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  33.9 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  38.69 
 
 		 192 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  39.85 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  34.44 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.48 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  35.56 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  30.41 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  40.56 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.3 
 
 		 643 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 322 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  39.74 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  46.88 
 
 		 267 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  48.48 
 
 		 519 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  31.29 
 
 		 334 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  27.03 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3492  type II secretion system protein  25 
 
 		 313 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39955  normal  0.0861426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3510  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.426579  normal  0.148834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 347 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  30.54 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 314 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 306 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  26 
 
 		 314 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  33.78 
 
 		 361 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 326 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 328 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.29 
 
 		 273 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 326 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 416 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 323 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  28.17 
 
 		 326 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 333 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 310 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  29.5 
 
 		 309 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  22.73 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.72 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  25.5 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 319 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  22.71 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  27.39 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0952  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 402 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.94 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  25.15 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>