34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4803 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  100 
 
 		 192 aa  352  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  100 
 
 		 192 aa  352  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  97.19 
 
 		 192 aa  274  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  67.79 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  64.33 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  52.3 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13687  alanine rich membrane protein  66.45 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.58076e-41  normal  0.106713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  54.3 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  55.78 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  46.38 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  47.55 
 
 		 267 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  49.56 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  41.91 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  40.29 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  42.57 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  39.74 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  40.54 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  27.95 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  42.71 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  35.11 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  37.41 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  36.96 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  34.12 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  50.75 
 
 		 519 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  40 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  47.92 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  33.96 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  26.57 
 
 		 322 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  36.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>