51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0366 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0366  type II secretion system protein  100 
 
 		 240 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0482  hypothetical protein  41.94 
 
 		 193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4419  type II secretion system protein  44.32 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.219258  hitchhiker  0.00591921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0216  type II secretion system protein  45.81 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0126  putative integral membrane protein  47.58 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160124  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5326  Type II secretion system F domain protein  40.18 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00292685  normal  0.534868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4836  type II secretion system protein  49.64 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4037  type II secretion system protein  44.09 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3906  Type II secretion system F domain protein  41.01 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1980  type II secretion system protein  34.9 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0594  Type II secretion system F domain protein  40.71 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0520  Type II secretion system F domain protein  38.73 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0278  type II secretion system protein  38.06 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0050  type II secretion system protein  42.57 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5868  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188424  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3159  type II secretion system protein  33.77 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3370  type II secretion system protein  34.84 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35900  Flp pilus assembly protein TadC  32.62 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25280  Flp pilus assembly protein TadC  37.84 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  35.85 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18180  type II secretion system protein F  35.61 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0621  type II secretion system protein  36.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.873004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0731  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0847953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1295  Flp pilus assembly protein  27.15 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2223  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 416 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.92852  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2775  Type II secretion system F domain protein  35.98 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000124346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  25.25 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0317  type II secretion system protein  46.03 
 
 		 519 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140124  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  25 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5405  type II secretion system protein  36.02 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901064  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0326  type II secretion system protein  35.88 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.173392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1386  type II secretion system protein  39.6 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0123649  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0680  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5190  type II secretion system protein  35.07 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139596  decreased coverage  0.0000686887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4889  type II secretion system protein  40 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.944047  normal  0.0709188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4803  type II secretion system protein  40 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0597  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  24.5 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0262  hypothetical protein  24.68 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000660114  hitchhiker  0.00000173551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25830  Flp pilus assembly protein TadB  39.19 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0122  hypothetical protein  25.16 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0479  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00167039  hitchhiker  0.0082018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  23.91 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>